Philipp Otto Gercken stammte aus Hildesheim und wirkte später als Jurist in seiner Geburtsstadt. Im Jahr 1667 verteidigte er an der Universität Jena unter dem Vorsitz Erhard Weigels die Schrift Amplissima in alma Salana Facultate Philosophica suffragante (VD17 23:240101N, Digitalisat).
Am 18. Juli 1672 ehelichte er in Hildesheim Anna Helene Storre (1652–1729), Tochter des Fürstlich-Braunschweigisch-Lüneburgischen Hofgerichtsassessors und Gräflich-Nassau-Spiegelbergischen Rat Hermann Storre (GEDBAS). Im darauffolgenden Jahr, am 8. Mai 1673 verstarb Philipp Otto Gercken nur 27jährig in Hildesheim.